| Acc# | Gene | Locus | DB | Organism | Product | Score | E-value | Identities | Positives | Gaps |
|---|
No hits above score 50
Scores for sequence family classification (score includes all domains): Model Description Score E-value N -------- ----------- ----- ------- --- Yeast_VAR1 Mitochondrial ribosomal protein (VAR1) -220.5 2.4 1 DUF229 Protein of unknown function (DUF229) -298.2 7.5 1 Parsed for domains: Model Domain seq-f seq-t hmm-f hmm-t score E-value -------- ------- ----- ----- ----- ----- ----- ------- Yeast_VAR1 1/1 255 541 .. 1 413 [] -220.5 2.4 DUF229 1/1 502 935 .. 1 561 [] -298.2 7.5
CDS Sequence
ATGAGTGATA ATGAAATTAA ATCATCTTCA ATGCATCATC ACCGTCATCA TCATCATCAT CAACTGCAAT TGCAAGAGGA ACAACTCTTA ACCAATGAAG ACAACTCCTA TTCTCAAAAC CAAAATAAAG ATAGCAGTGA TAGTTGCTTA ACTGCTCCAC TTATAACTGA TATAAACACC ACTAATAATG GCATACAACT TAATCAAGAA CAACCATTAG TACCATATGA TTCATCAAAT GAAGAAACCC CGTTATTATT AAATAATTCA ATATCCACTA TCACCACCAC CACTACCACC ACTAAGTCAT CACAATCAAC ATGCTTCACT TGGTATTATA TTATAATAAT AATAACATCT ATAATATTGA TTGGATTATT ATGGGGTGGT ATTATTTATA ATATTGTTCA TAACATTGAA TCATCAATTA ACGATTCCAT TCAATTTAAT CTTGATCAAG TATCGATTCA ACTGATAACT TCTCAAGGTA TCAATATTCA TATATTAGGT TCAATTGATA TTAATTATAA TGATATTATT AATCTGATTC AACGGAATTC AATTAAATTG ATTACTGGGA TATTTGGTAG TTTAACAATT ATAAATTTAC AACCCATTGA AATTTATAGT AAATTTATTG ATTTAGAAGA AAATGACAAC CTGTCGTTTA TTCATTTGGT GGATTCTTAT ATTCCTTCAA TACAACCAAT TGATATTAAA ATTGGGAATT TACAAACTAC TGATATTGAT ATTATATCAT CTTGTAAATT TATTAATAAT GAAAATTTTA TGAAATTTTT AAATGATTAT TATAAATTAC AAAATGATGA TGATGATGAT GAGGAGGATG ATAAAATTAA TTTGAAAATT AAAGGATTAG TTAAACAAGT CAAAATTAAA TTATGGTGGA TGATTCTGTA TGATGTGGAA AATATTGAAT TTTATAAAGA TGTAACAATT TATAAACATG ATATTATACC TACAGTTAAT ATTGATAAAT TTAATCTTTA TTCAACAATT GATAATAAAG GTAATGATAT TATTAATATT AAAATTAATG CTTTAATTGA AATACCAAAA TTTATTTTAT CATCAATTCC AAATTTAAAA TTTAAATTTG GCTTTATTAA TTGGAATTTA TTTTTCAATG ATTGTGATGG GATAGATAAA TTAATTAAAG TGGGATATTG GCAAAGTTGT CCATTTCAAA TAGTACACCA AGAAGGAGAA AACCTATATC AACCTATTTT ATTGACAGTC ATAGGGAATA TATCATCTAT ACCTGATGAA TTAATGAATG AATGTCCTAA TAATAATGAT GGTAAAAGTC CATTAAATAA AATATTACAA AAATATTTAG ATAATGAACC CATTGAATTT TATCTACAAT TGTTAAGTAG TTTAGATGAA AACGATAATG GGATACCTGA TTGGTTATTT AAATTTTTAC ATGATACACC AATTAAATTA ACTATAACAT TACCGAAAAT GAATATAGAT CAATTTGATT TTCATGAAAA TCTTGAAATT ATAAATCATT CATCTGAAGT TTCGATAATG AATAATGATC AATTTTTAGT TAGTCATTGG AATTCTAATA TTTCAACATT AATTACAACA ATAAAACCAT TCAAACTGGT AGATTTGGAT ATAAATAAAT TTAAATTTGA TTTTGAAATA TCGTCTATTG ATAATAATGT TTTAGTTAAA GTCAATTCTA ATGATGAATA TATTTATATA ACTATGATTA ATGATAATCA AGAATTGATT AATATGGTTA TGAATTTACC AAATTTGAAT ATTTCAATAA TTGATGCCCA CCAAATGGGC AATATTATCA ATAAACTACT CAATAGGGAT TATACGGATA ACGATGGAGA AAAAGAACCG GACTTGTTTA TTGAAGGTAA TGTATATGAC GTATATGGGA ATTTACCAAT ATGGAAAAAC AACAACAACA ACAACAAGCA AAGGAAGTTG ATTGATCATT TATCTATACC ATTGATGAAA TTACCAAAAT TATCAACTAT GGAAAGTTTT CCAGCTTATA CTTTGGATAC GTTATCAAAT TTAACTATTA CAATAACAAA CCTTTATTTA ATTGAATCAA CTATTCGAAA ACTTGAATTA TCAATTGATT TAACTATTTA TAATCCAACC AATTTCAACA TTAATTTAGA TTCATCAATA TTAATAGATT CAATAATTTG GCAAATTTTT AAAAATGATT CATTAATTAG TTCAATAAAA GTATCAATAC CGGACACTAA AGGTGGAAAT GGAAATGGAA ATGAAAATGG AAATGGAAAT TTATTCATCC CTATTCAAGA TTATTTCAAT ACAACTATGA AGATAAATAT TTACTCATTA AATTATCGAG ATAAATCAAT ATTAGAAAAT TCAATAAGTT CATTCATATC AAATGATAAT TTATCCAATA TCACCGTAGC ACCAGTCATT CCCATTATCC ATTCTAATCC ATTGATGGAA TTATTATTAC CAATTGAATT AACTAATATA ACAATAAATT CACAAATCTT AACAAATGGT ATAATAAATT TCCCAGAAAA ATTGATTCAA AATATTCAAA TTCATTTATT AACTTCACAA ATCCAATTTG AAATTTATAA CCCAATAATT AATTCTTCAA TTATATTGTA TATTTATACT GGGTTAGCTA AAACCAATAC CACCACAGAT GGAAGTGGAG ATGGTGATGG GGATGGTGAC GGTGATGTTA TTGAATTGGG TCATTTATTA CATCAAGAAC GATTAATTAT TCCATTTTCA CAAAATGGAC AAAATGGGAT TTATAAATCA CCGAAATTAC CAATTAAAAT AAACCCAATG GGTATGGAAA TCTTGAAGAA AATTTTATAT GAAAAACCTG ATCCTGATGG AAAACATTCT GTGAAAAATG TGGAAATAAA TACTGTATTT AATGTTAAAA TTGATCAATT TGATGTTGAA TTATATTATA ATGGTAATAT TGATGTGAAA TTGGCCATGT AA
AA Sequence
MSDNEIKSSS MHHHRHHHHH QLQLQEEQLL TNEDNSYSQN QNKDSSDSCL TAPLITDINT TNNGIQLNQE QPLVPYDSSN EETPLLLNNS ISTITTTTTT TKSSQSTCFT WYYIIIIITS IILIGLLWGG IIYNIVHNIE SSINDSIQFN LDQVSIQLIT SQGINIHILG SIDINYNDII NLIQRNSIKL ITGIFGSLTI INLQPIEIYS KFIDLEENDN LSFIHLVDSY IPSIQPIDIK IGNLQTTDID IISSCKFINN ENFMKFLNDY YKLQNDDDDD EEDDKINLKI KGLVKQVKIK LWWMILYDVE NIEFYKDVTI YKHDIIPTVN IDKFNLYSTI DNKGNDIINI KINALIEIPK FILSSIPNLK FKFGFINWNL FFNDCDGIDK LIKVGYWQSC PFQIVHQEGE NLYQPILLTV IGNISSIPDE LMNECPNNND GKSPLNKILQ KYLDNEPIEF YLQLLSSLDE NDNGIPDWLF KFLHDTPIKL TITLPKMNID QFDFHENLEI INHSSEVSIM NNDQFLVSHW NSNISTLITT IKPFKLVDLD INKFKFDFEI SSIDNNVLVK VNSNDEYIYI TMINDNQELI NMVMNLPNLN ISIIDAHQMG NIINKLLNRD YTDNDGEKEP DLFIEGNVYD VYGNLPIWKN NNNNNKQRKL IDHLSIPLMK LPKLSTMESF PAYTLDTLSN LTITITNLYL IESTIRKLEL SIDLTIYNPT NFNINLDSSI LIDSIIWQIF KNDSLISSIK VSIPDTKGGN GNGNENGNGN LFIPIQDYFN TTMKINIYSL NYRDKSILEN SISSFISNDN LSNITVAPVI PIIHSNPLME LLLPIELTNI TINSQILTNG IINFPEKLIQ NIQIHLLTSQ IQFEIYNPII NSSIILYIYT GLAKTNTTTD GSGDGDGDGD GDVIELGHLL HQERLIIPFS QNGQNGIYKS PKLPIKINPM GMEILKKILY EKPDPDGKHS VKNVEINTVF NVKIDQFDVE LYYNGNIDVK LAM*